Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y289

SLC5A6, Sodium-dependent multivitamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6Q9Y289 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC5A6Q9Y289 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC5A6Q9Y289 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms