Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCML1Q9UN30 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SCML1Q9UN30 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms