Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHTF1Q9UMS5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PHTF1Q9UMS5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PHTF1Q9UMS5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms