Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMFRQ9UKV5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMFRQ9UKV5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMFRQ9UKV5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms