Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF20Q9UGU0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF20Q9UGU0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCF20Q9UGU0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms