Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCND1Q9NSA2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCND1Q9NSA2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCND1Q9NSA2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms