Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C8orf4Q9NR00 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C8orf4Q9NR00 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms