Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
MED4Q9NPJ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MED4Q9NPJ6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms