Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
USP44Q9H0E7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
USP44Q9H0E7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
USP44Q9H0E7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP44Q9H0E7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms