Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PARD6BQ9BYG5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PARD6BQ9BYG5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PARD6BQ9BYG5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PARD6BQ9BYG5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PARD6BQ9BYG5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms