Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG8

KIFC3, Kinesin-like protein KIFC3, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3Q9BVG8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KIFC3Q9BVG8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KIFC3Q9BVG8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KIFC3Q9BVG8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KIFC3Q9BVG8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms