Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR46

C20orf78, Putative uncharacterized protein C20orf78, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf78Q9BR46 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C20orf78Q9BR46 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C20orf78Q9BR46 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C20orf78Q9BR46 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C20orf78Q9BR46 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C20orf78Q9BR46 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C20orf78Q9BR46 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C20orf78Q9BR46 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C20orf78Q9BR46 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C20orf78Q9BR46 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C20orf78Q9BR46 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
C20orf78Q9BR46 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
C20orf78Q9BR46 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms