Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MMS19Q96T76 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MMS19Q96T76 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMS19Q96T76 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms