Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KC1Q96S38 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPS6KC1Q96S38 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPS6KC1Q96S38 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1200 ms