Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
UIMC1Q96RL1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
UIMC1Q96RL1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UIMC1Q96RL1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms