Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OPALINQ96PE5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OPALINQ96PE5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms