Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNIP3Q96KP6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNIP3Q96KP6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms