Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
USP47Q96K76 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
USP47Q96K76 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
USP47Q96K76 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
USP47Q96K76 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
USP47Q96K76 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
USP47Q96K76 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
USP47Q96K76 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
USP47Q96K76 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
USP47Q96K76 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms