Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC41A2Q96JW4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC41A2Q96JW4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC41A2Q96JW4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.2 ms