Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SCARF2Q96GP6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCARF2Q96GP6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCARF2Q96GP6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms