Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE9

CXorf40B, Protein CXorf40B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40BQ96DE9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXorf40BQ96DE9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXorf40BQ96DE9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXorf40BQ96DE9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms