Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP7Q93009 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP7Q93009 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP7Q93009 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP7Q93009 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP7Q93009 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP7Q93009 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP7Q93009 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP7Q93009 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP7Q93009 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP7Q93009 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP7Q93009 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP7Q93009 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP7Q93009 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP7Q93009 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP7Q93009 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP7Q93009 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP7Q93009 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP7Q93009 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP7Q93009 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP7Q93009 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP7Q93009 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP7Q93009 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
USP7Q93009 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP7Q93009 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP7Q93009 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP7Q93009 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP7Q93009 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP7Q93009 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP7Q93009 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP7Q93009 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP7Q93009 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP7Q93009 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP7Q93009 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
USP7Q93009 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP7Q93009 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP7Q93009 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP7Q93009 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP7Q93009 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP7Q93009 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP7Q93009 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP7Q93009 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP7Q93009 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP7Q93009 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP7Q93009 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP7Q93009 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP7Q93009 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP7Q93009 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP7Q93009 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP7Q93009 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP7Q93009 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP7Q93009 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP7Q93009 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP7Q93009 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP7Q93009 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP7Q93009 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP7Q93009 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP7Q93009 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP7Q93009 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP7Q93009 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP7Q93009 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP7Q93009 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP7Q93009 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP7Q93009 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP7Q93009 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP7Q93009 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP7Q93009 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP7Q93009 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP7Q93009 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP7Q93009 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP7Q93009 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP7Q93009 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP7Q93009 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP7Q93009 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP7Q93009 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP7Q93009 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP7Q93009 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP7Q93009 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP7Q93009 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP7Q93009 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP7Q93009 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP7Q93009 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP7Q93009 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP7Q93009 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP7Q93009 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP7Q93009 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP7Q93009 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP7Q93009 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP7Q93009 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
USP7Q93009 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP7Q93009 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP7Q93009 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP7Q93009 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP7Q93009 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP7Q93009 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP7Q93009 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP7Q93009 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP7Q93009 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP7Q93009 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP7Q93009 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms