Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNPO1Q92973 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNPO1Q92973 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
TNPO1Q92973 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNPO1Q92973 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms