Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA1Q92743 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA1Q92743 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA1Q92743 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA1Q92743 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA1Q92743 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HTRA1Q92743 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA1Q92743 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA1Q92743 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA1Q92743 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HTRA1Q92743 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA1Q92743 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA1Q92743 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA1Q92743 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA1Q92743 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA1Q92743 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA1Q92743 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA1Q92743 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HTRA1Q92743 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA1Q92743 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA1Q92743 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA1Q92743 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA1Q92743 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA1Q92743 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA1Q92743 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA1Q92743 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HTRA1Q92743 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HTRA1Q92743 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HTRA1Q92743 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms