Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB1

LNX1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX1Q8TBB1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LNX1Q8TBB1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LNX1Q8TBB1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LNX1Q8TBB1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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