Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM87AQ8NBN3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMEM87AQ8NBN3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM87AQ8NBN3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM87AQ8NBN3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms