Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP11CQ8NB49 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP11CQ8NB49 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP11CQ8NB49 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms