Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC33Q8N5R6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC33Q8N5R6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms