Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C17orf53Q8N3J3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C17orf53Q8N3J3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C17orf53Q8N3J3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C17orf53Q8N3J3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C17orf53Q8N3J3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
C17orf53Q8N3J3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C17orf53Q8N3J3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms