Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE2Q1Q7Z7E8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBE2Q1Q7Z7E8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26■■□□□ 1.75
UBE2Q1Q7Z7E8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms