Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC46A3Q7Z3Q1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC46A3Q7Z3Q1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms