Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZBED9Q6R2W3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZBED9Q6R2W3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZBED9Q6R2W3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms