Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOCADQ5VW36 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
FOCADQ5VW36 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FOCADQ5VW36 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms