Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RIF1Q5UIP0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RIF1Q5UIP0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RIF1Q5UIP0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms