Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FRMPD1Q5SYB0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
FRMPD1Q5SYB0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
FRMPD1Q5SYB0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
FRMPD1Q5SYB0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
FRMPD1Q5SYB0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms