Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf116Q5BN46 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf116Q5BN46 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms