Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C5orf22Q49AR2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C5orf22Q49AR2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C5orf22Q49AR2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C5orf22Q49AR2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C5orf22Q49AR2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
C5orf22Q49AR2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C5orf22Q49AR2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms