Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELOBQ15370 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ELOBQ15370 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ELOBQ15370 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ELOBQ15370 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ELOBQ15370 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELOBQ15370 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELOBQ15370 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms