Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATRQ13535 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATRQ13535 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATRQ13535 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATRQ13535 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATRQ13535 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATRQ13535 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRQ13535 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRQ13535 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRQ13535 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRQ13535 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRQ13535 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRQ13535 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRQ13535 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRQ13535 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRQ13535 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATRQ13535 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRQ13535 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRQ13535 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRQ13535 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRQ13535 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRQ13535 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRQ13535 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRQ13535 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRQ13535 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRQ13535 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRQ13535 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRQ13535 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRQ13535 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRQ13535 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRQ13535 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRQ13535 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRQ13535 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATRQ13535 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATRQ13535 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATRQ13535 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATRQ13535 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATRQ13535 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATRQ13535 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATRQ13535 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATRQ13535 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATRQ13535 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATRQ13535 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRQ13535 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRQ13535 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRQ13535 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRQ13535 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRQ13535 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRQ13535 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRQ13535 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRQ13535 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRQ13535 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATRQ13535 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATRQ13535 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATRQ13535 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATRQ13535 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATRQ13535 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATRQ13535 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATRQ13535 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ATRQ13535 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ATRQ13535 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATRQ13535 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATRQ13535 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ATRQ13535 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATRQ13535 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATRQ13535 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATRQ13535 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATRQ13535 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATRQ13535 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRQ13535 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRQ13535 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRQ13535 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRQ13535 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRQ13535 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRQ13535 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRQ13535 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRQ13535 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRQ13535 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRQ13535 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRQ13535 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRQ13535 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRQ13535 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRQ13535 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRQ13535 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRQ13535 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRQ13535 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRQ13535 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRQ13535 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRQ13535 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRQ13535 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRQ13535 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRQ13535 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRQ13535 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRQ13535 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRQ13535 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRQ13535 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRQ13535 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRQ13535 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRQ13535 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRQ13535 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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