Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AP3B2Q13367 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AP3B2Q13367 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AP3B2Q13367 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AP3B2Q13367 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms