Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
EMX1Q04741 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EMX1Q04741 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms