Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PRB3Q04118 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PRB3Q04118 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms