Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 SKN1YGR143W 2316 nt6.33□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 IMA2YOL157C 1770 nt6.33□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 VMS1YDR049W 1899 nt6.32□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 NOP7YGR103W 1818 nt6.32□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 IMA5YJL216C 1746 nt6.31□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 QDR3YBR043C 2070 nt6.31□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 MTQ1YNL063W 945 nt6.31□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 ROX3YBL093C 663 nt6.31□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 ATP1YBL099W 1638 nt6.31□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 MLF3YNL074C 1359 nt6.31□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt6.3□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 LSG1YGL099W 1923 nt6.3□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 FET3YMR058W 1911 nt6.3□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 PPM1YDR435C 987 nt6.29□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 YDR541CYDR541C 1035 nt6.29□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 ACF2YLR144C 2340 nt6.29□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 RCL1YOL010W 1104 nt6.29□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 BZZ1YHR114W 1902 nt6.29□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 IDP1YDL066W 1287 nt6.28□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 YHR140WYHR140W 720 nt6.28□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 MRL1YPR079W 1146 nt6.28□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 ULA1YPL003W 1389 nt6.28□□□□□ -1.4
SYF1Q04048 ECM7YLR443W 1347 nt6.27□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 YEL020CYEL020C 1683 nt6.27□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 SNF11YDR073W 510 nt6.27□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 MTQ2YDR140W 666 nt6.27□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 RPN12YFR052W 825 nt6.27□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 GUS1YGL245W 2127 nt6.27□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 YML6YML025C 861 nt6.27□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 YML131WYML131W 1098 nt6.27□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 STE13YOR219C 2796 nt6.27□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 BAP2YBR068C 1830 nt6.27□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 COQ6YGR255C 1440 nt6.26□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 MSH1YHR120W 2880 nt6.26□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 YKR073CYKR073C 321 nt6.26□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 SAC6YDR129C 1929 nt6.26□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 GYP1YOR070C 1914 nt6.26□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 CBT1YKL208W 816 nt6.25□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 RDL1YOR285W 420 nt6.25□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 ATG18YFR021W 1503 nt6.25□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 LAS21YJL062W 2493 nt6.24□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 VPS29YHR012W 849 nt6.24□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 YIL077CYIL077C 963 nt6.24□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 CKB2YOR039W 777 nt6.24□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 ENT2YLR206W 1842 nt6.24□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 SNT2YGL131C 4212 nt6.24□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 YGR139WYGR139W 339 nt6.23□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 TOM5YPR133W-A 153 nt6.23□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 HSF1YGL073W 2502 nt6.23□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 GUA1YMR217W 1578 nt6.23□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 UTP9YHR196W 1728 nt6.22□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 CDC10YCR002C 969 nt6.22□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 TRP1YDR007W 675 nt6.22□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 ADK2YER170W 678 nt6.22□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 OAC1YKL120W 975 nt6.22□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 DOM34YNL001W 1161 nt6.22□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 APJ1YNL077W 1587 nt6.22□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 TRP5YGL026C 2124 nt6.22□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 UTP18YJL069C 1785 nt6.21□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 FAA4YMR246W 2085 nt6.21□□□□□ -1.41
SYF1Q04048 MNN10YDR245W 1182 nt6.21□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 YLR317WYLR317W 435 nt6.21□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 NOP8YOL144W 1455 nt6.21□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 GPT2YKR067W 2232 nt6.21□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 HAS1YMR290C 1518 nt6.2□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 YPT32YGL210W 669 nt6.2□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 MGR2YPL098C 342 nt6.2□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 VPS1YKR001C 2115 nt6.2□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 MKC7YDR144C 1791 nt6.19□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 HSP150YJL159W 1242 nt6.19□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 PEX22YAL055W 543 nt6.19□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 DFG5YMR238W 1377 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 STB5YHR178W 2232 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 YIL067CYIL067C 2037 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 HRP1YOL123W 1605 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 QRI1YDL103C 1434 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 AVO1YOL078W 3531 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 RPL7AYGL076C 735 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 GPM3YOL056W 912 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 FEX1YOR390W 1128 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 RPL7BYPL198W 735 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 FEX2YPL279C 1128 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 VPS70YJR126C 2436 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 HIR1YBL008W 2523 nt6.18□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 GCS1YDL226C 1059 nt6.17□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 RPS19BYNL302C 435 nt6.17□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 OAZ1YPL052W 879 nt6.17□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 GAL10YBR019C 2100 nt6.17□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 MTC5YDR128W 3447 nt6.16□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 TOM20YGR082W 552 nt6.16□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 CAB4YGR277C 918 nt6.16□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 BGL2YGR282C 942 nt6.16□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt6.16□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 YOL131WYOL131W 327 nt6.16□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 CAM1YPL048W 1248 nt6.16□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 PIF1YML061C 2580 nt6.15□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 YDR514CYDR514C 1452 nt6.15□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 DRN1YGR093W 1524 nt6.15□□□□□ -1.42
SYF1Q04048 KEL1YHR158C 3495 nt6.15□□□□□ -1.43
SYF1Q04048 AVT3YKL146W 2079 nt6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 73 ms