Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NHLH1Q02575 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NHLH1Q02575 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms