Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MS4A2Q01362 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MS4A2Q01362 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MS4A2Q01362 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms