Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABARAPL2P60520 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GABARAPL2P60520 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABARAPL2P60520 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABARAPL2P60520 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABARAPL2P60520 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GABARAPL2P60520 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPL2P60520 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPL2P60520 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GABARAPL2P60520 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms