Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DCDC1P59894 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCDC1P59894 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms