Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tpm1P58771 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tpm1P58771 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tpm1P58771 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms