RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109477.1

Ccdc88a-202, Transcript of Girdin, mousemouse

TSL 2 BASIC

Gene Ccdc88a, Length 1,716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa45,17■■■■■ 4,82
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 NischQ80TM9 1593 aa44,88■■■■■ 4,77
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Abcc9P70170 1546 aa43,48■■■■■ 4,55
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Abcc8B2RUS7 1588 aa43,22■■■■■ 4,51
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 ScribQ80U72 1612 aa41,3■■■■■ 4,2
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 NacadQ5SWP3 1504 aa40,09■■■■■ 4,01
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Kdm5dQ62240 1548 aa40,09■■■■■ 4,01
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Dcaf1Q80TR8 1506 aa39,95■■■■□ 3,99
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Rhox8Q6VSS7 320 aa39,71■■■■□ 3,95
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Sycp2Q9CUU3 1500 aa39,28■■■■□ 3,88
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa39,14■■■■□ 3,86
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Ccdc180J3QNE4 1664 aa38,71■■■■□ 3,79
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 BicraF8VPZ9 1578 aa38,65■■■■□ 3,78
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Baz1aO88379 1555 aa38,64■■■■□ 3,78
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Crybg2B7ZCC2 1516 aa38,43■■■■□ 3,74
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Rtl1Q7M732 1744 aa38,42■■■■□ 3,74
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP37,98■■■■□ 3,67
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Smarca2Q6DIC0 1577 aa37,58■■■■□ 3,61
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP37,42■■■■□ 3,58
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa37,25■■■■□ 3,55
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP37,21■■■■□ 3,55
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP37,12■■■■□ 3,53
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa36,93■■■■□ 3,5
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP36,86■■■■□ 3,49
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa36,83■■■■□ 3,49
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa36,74■■■■□ 3,47
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Ercc6F8VPZ5 1481 aa36,62■■■■□ 3,45
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP36,56■■■■□ 3,44
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 CftrP26361 1476 aa36,51■■■■□ 3,43
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Synj1Q8CHC4 1574 aa36,48■■■■□ 3,43
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Trim41Q5NCC3 630 aa36,45■■■■□ 3,43
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Wdr62Q3U3T8 1523 aa36,43■■■■□ 3,42
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Frmpd1A2AKB4 1549 aa36,4■■■■□ 3,42
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa36,4■■■■□ 3,42
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa36,32■■■■□ 3,4
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Fam135aQ6NS59 1506 aa36,16■■■■□ 3,38
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP36,06■■■■□ 3,36
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP35,89■■■■□ 3,34
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Unc13aQ4KUS2 1712 aa35,89■■■■□ 3,34
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Ubl4bQ9CQ84 188 aa35,72■■■■□ 3,31
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Baz1bQ9Z277 1479 aa35,72■■■■□ 3,31
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Golga3P55937 1487 aa35,66■■■■□ 3,3
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 HrcG5E8J6 738 aa35,6■■■■□ 3,29
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Top2bQ64511 1612 aa35,52■■■■□ 3,28
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Cngb1E1AZ71 1325 aa35,5■■■■□ 3,27
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP35,41■■■■□ 3,26
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Mrc2Q64449 1479 aa35,32■■■■□ 3,24
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Kif15Q6P9L6 1387 aa35,31■■■■□ 3,24
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Lamc3Q9R0B6 1581 aa35,28■■■■□ 3,24
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Cux2P70298 1426 aa35,14■■■■□ 3,22
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 TnnQ80Z71 1560 aa35,06■■■■□ 3,2
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Cep164Q5DU05 1446 aa35,04■■■■□ 3,2
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa35,03■■■■□ 3,2
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Fmn1Q05860 1466 aa35,02■■■■□ 3,2
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Chic1Q8CBW7 227 aa34,9■■■■□ 3,18
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP34,82■■■■□ 3,16
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Ccdc18Q640L5 1455 aa34,74■■■■□ 3,15
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Camsap1A2AHC3 1581 aa34,71■■■■□ 3,15
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Kif21aQ9QXL2 1672 aa34,7■■■■□ 3,14
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Il27Q8K3I6 234 aa34,67■■■■□ 3,14
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP34,62■■■■□ 3,13
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP34,52■■■■□ 3,12
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa34,49■■■■□ 3,11
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP34,45■■■■□ 3,11
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP34,35■■■■□ 3,09
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Grin2bQ01097 1482 aa34,32■■■■□ 3,08
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Gab3Q8BSM5 595 aa34,3■■■■□ 3,08
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Crocc2F6XLV1 1638 aa34,25■■■■□ 3,07
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP34,23■■■■□ 3,07
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Plb1Q3TTY0 1478 aa34,22■■■■□ 3,07
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Duox2A2AQ99 1517 aa34,2■■■■□ 3,07
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 NrkQ9R0G8 1455 aa34,1■■■■□ 3,05
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa34,09■■■■□ 3,05
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Efcab5A0JP43 1406 aa34,08■■■■□ 3,05
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP34■■■■□ 3,03
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 PtprkP35822 1457 aa33,97■■■■□ 3,03
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Shroom4Q1W617 1475 aa33,96■■■■□ 3,03
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Ift140E9PY46 1464 aa33,93■■■■□ 3,02
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Samd9lQ69Z37 1561 aa33,93■■■■□ 3,02
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Npm2Q80W85 207 aa33,83■■■■□ 3,01
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Disp1Q3TDN0 1521 aa33,83■■■■□ 3,01
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Cep162Q6ZQ06 1403 aa33,81■■■■□ 3
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP33,79■■■■□ 3
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Rad54l2Q99NG0 1466 aa33,72■■■□□ 2,99
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Rusc2Q80U22 1514 aa33,66■■■□□ 2,98
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP33,65■■■□□ 2,98
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP33,62■■■□□ 2,97
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Arhgap35Q91YM2 1499 aa33,61■■■□□ 2,97
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Setd1bQ8CFT2 1985 aa33,6■■■□□ 2,97
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Magi3Q9EQJ9 1476 aa33,59■■■□□ 2,97
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 SynmQ70IV5 1561 aa33,59■■■□□ 2,97
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Grin2aP35436 1464 aa33,56■■■□□ 2,96
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa33,54■■■□□ 2,96
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Map3k1P53349 1493 aa33,54■■■□□ 2,96
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa33,54■■■□□ 2,96
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Zeb1Q64318 1117 aa33,54■■■□□ 2,96
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Pla2r1Q62028 1487 aa33,47■■■□□ 2,95
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Myt1lP97500 1187 aa33,45■■■□□ 2,95
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 Gpatch8A2A6A1 1505 aa33,38■■■□□ 2,93
Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP33,34■■■□□ 2,93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11,2 ms