Protein–RNA interactions for Protein: P53040

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, yeastyeast

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF6P53040 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.38□□□□□ -1.55
TAF6P53040 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.38□□□□□ -1.55
TAF6P53040 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.38□□□□□ -1.55
TAF6P53040 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.38□□□□□ -1.55
TAF6P53040 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.38□□□□□ -1.55
TAF6P53040 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.38□□□□□ -1.55
TAF6P53040 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.38□□□□□ -1.55
TAF6P53040 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.38□□□□□ -1.55
TAF6P53040 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.38□□□□□ -1.55
TAF6P53040 XPT1YJR133W 630 nt5.38□□□□□ -1.55
TAF6P53040 ODC2YOR222W 924 nt5.38□□□□□ -1.55
TAF6P53040 ULA1YPL003W 1389 nt5.38□□□□□ -1.55
TAF6P53040 CTR3YLR411W 726 nt5.37□□□□□ -1.55
TAF6P53040 ERG7YHR072W 2196 nt5.37□□□□□ -1.55
TAF6P53040 VPS72YDR485C 2388 nt5.37□□□□□ -1.55
TAF6P53040 SIP5YMR140W 1470 nt5.37□□□□□ -1.55
TAF6P53040 CTS1YLR286C 1689 nt5.37□□□□□ -1.55
TAF6P53040 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5.36□□□□□ -1.55
TAF6P53040 COX11YPL132W 903 nt5.36□□□□□ -1.55
TAF6P53040 SUE1YPR151C 621 nt5.36□□□□□ -1.55
TAF6P53040 TAX4YJL083W 1815 nt5.36□□□□□ -1.55
TAF6P53040 PPR1YLR014C 2715 nt5.36□□□□□ -1.55
TAF6P53040 MSS116YDR194C 1995 nt5.35□□□□□ -1.55
TAF6P53040 VBA1YMR088C 1689 nt5.35□□□□□ -1.55
TAF6P53040 PUS1YPL212C 1635 nt5.35□□□□□ -1.55
TAF6P53040 DFG5YMR238W 1377 nt5.35□□□□□ -1.55
TAF6P53040 RBA50YDR527W 1320 nt5.35□□□□□ -1.55
TAF6P53040 YDL034WYDL034W 345 nt5.35□□□□□ -1.55
TAF6P53040 BNS1YGR230W 414 nt5.35□□□□□ -1.55
TAF6P53040 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.35□□□□□ -1.55
TAF6P53040 ROX3YBL093C 663 nt5.35□□□□□ -1.55
TAF6P53040 TAH18YPR048W 1872 nt5.34□□□□□ -1.55
TAF6P53040 PDI1YCL043C 1569 nt5.34□□□□□ -1.55
TAF6P53040 ATG23YLR431C 1362 nt5.34□□□□□ -1.55
TAF6P53040 REV7YIL139C 738 nt5.34□□□□□ -1.55
TAF6P53040 YLL059CYLL059C 507 nt5.34□□□□□ -1.55
TAF6P53040 ISU2YOR226C 471 nt5.34□□□□□ -1.55
TAF6P53040 PDB1YBR221C 1101 nt5.34□□□□□ -1.55
TAF6P53040 ARO10YDR380W 1908 nt5.34□□□□□ -1.55
TAF6P53040 CCZ1YBR131W 2115 nt5.33□□□□□ -1.56
TAF6P53040 VMA13YPR036W 1437 nt5.33□□□□□ -1.56
TAF6P53040 EEB1YPL095C 1371 nt5.33□□□□□ -1.56
TAF6P53040 VAM7YGL212W 951 nt5.33□□□□□ -1.56
TAF6P53040 GTO1YGR154C 1071 nt5.33□□□□□ -1.56
TAF6P53040 DCI1YOR180C 816 nt5.33□□□□□ -1.56
TAF6P53040 YPL102CYPL102C 303 nt5.33□□□□□ -1.56
TAF6P53040 EIS1YMR031C 2532 nt5.33□□□□□ -1.56
TAF6P53040 FET3YMR058W 1911 nt5.33□□□□□ -1.56
TAF6P53040 ECM3YOR092W 1842 nt5.32□□□□□ -1.56
TAF6P53040 CUE2YKL090W 1332 nt5.32□□□□□ -1.56
TAF6P53040 SCW4YGR279C 1161 nt5.32□□□□□ -1.56
TAF6P53040 PHO86YJL117W 936 nt5.32□□□□□ -1.56
TAF6P53040 SEN34YAR008W 828 nt5.32□□□□□ -1.56
TAF6P53040 SNO4YMR322C 714 nt5.32□□□□□ -1.56
TAF6P53040 HSP33YOR391C 714 nt5.32□□□□□ -1.56
TAF6P53040 HSP32YPL280W 714 nt5.32□□□□□ -1.56
TAF6P53040 SED4YCR067C 3198 nt5.32□□□□□ -1.56
TAF6P53040 APM2YHL019C 1818 nt5.32□□□□□ -1.56
TAF6P53040 snR10snR10 245 nt5.31□□□□□ -1.56
TAF6P53040 SLD7YOR060C 774 nt5.31□□□□□ -1.56
TAF6P53040 GRS1YBR121C 2004 nt5.31□□□□□ -1.56
TAF6P53040 PAP1YKR002W 1707 nt5.31□□□□□ -1.56
TAF6P53040 ATG20YDL113C 1923 nt5.31□□□□□ -1.56
TAF6P53040 MGS1YNL218W 1764 nt5.3□□□□□ -1.56
TAF6P53040 MCH4YOL119C 1506 nt5.3□□□□□ -1.56
TAF6P53040 SHP1YBL058W 1272 nt5.3□□□□□ -1.56
TAF6P53040 ARB1YER036C 1833 nt5.3□□□□□ -1.56
TAF6P53040 GLT1YDL171C 6438 nt5.29□□□□□ -1.56
TAF6P53040 YNL247WYNL247W 2304 nt5.29□□□□□ -1.56
TAF6P53040 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.29□□□□□ -1.56
TAF6P53040 AAD4YDL243C 990 nt5.29□□□□□ -1.56
TAF6P53040 YGR176WYGR176W 348 nt5.29□□□□□ -1.56
TAF6P53040 JJJ3YJR097W 519 nt5.29□□□□□ -1.56
TAF6P53040 SWP1YMR149W 861 nt5.29□□□□□ -1.56
TAF6P53040 LST8YNL006W 912 nt5.29□□□□□ -1.56
TAF6P53040 ARR3YPR201W 1215 nt5.29□□□□□ -1.56
TAF6P53040 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.29□□□□□ -1.56
TAF6P53040 OCA5YHL029C 2040 nt5.29□□□□□ -1.56
TAF6P53040 ERD1YDR414C 1089 nt5.28□□□□□ -1.56
TAF6P53040 YER187WYER187W 426 nt5.28□□□□□ -1.56
TAF6P53040 YHR145CYHR145C 357 nt5.28□□□□□ -1.56
TAF6P53040 COS9YKL219W 1224 nt5.28□□□□□ -1.56
TAF6P53040 DOM34YNL001W 1161 nt5.28□□□□□ -1.56
TAF6P53040 MDY2YOL111C 639 nt5.28□□□□□ -1.56
TAF6P53040 BUB3YOR026W 1026 nt5.28□□□□□ -1.56
TAF6P53040 CAD1YDR423C 1230 nt5.27□□□□□ -1.57
TAF6P53040 UTR4YEL038W 684 nt5.27□□□□□ -1.57
TAF6P53040 ARP1YHR129C 1155 nt5.27□□□□□ -1.57
TAF6P53040 PRP45YAL032C 1140 nt5.27□□□□□ -1.57
TAF6P53040 YKR073CYKR073C 321 nt5.27□□□□□ -1.57
TAF6P53040 NOP2YNL061W 1857 nt5.27□□□□□ -1.57
TAF6P53040 FOB1YDR110W 1701 nt5.26□□□□□ -1.57
TAF6P53040 UGA1YGR019W 1416 nt5.26□□□□□ -1.57
TAF6P53040 NOP7YGR103W 1818 nt5.26□□□□□ -1.57
TAF6P53040 TFS1YLR178C 660 nt5.26□□□□□ -1.57
TAF6P53040 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.26□□□□□ -1.57
TAF6P53040 YOR200WYOR200W 399 nt5.26□□□□□ -1.57
TAF6P53040 RPL21BYPL079W 483 nt5.26□□□□□ -1.57
TAF6P53040 RIM15YFL033C 5313 nt5.26□□□□□ -1.57
TAF6P53040 TOS4YLR183C 1470 nt5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms